Situé à côté de la cathédrale de Saint-Claude, dans l'ancien palais abbatial (XVe - XVIIIe siècle) restauré, le musée de l'abbaye propose un fond XXe siècle constitué d'une collection léguée par les artistes Guy Bardone et René Genis, et un sous-sol comprenant des vestiges archéologiques attestant de la présence de l'un des plus anciens monastères de France. Représentative de la peinture française des années 20 à 60, la collection témoigne d'une orientation figurative dont les artistes ont été rassemblés sous le vocable des Peintres de la réalité poétique (Maurice Brianchon, Raymond Legueult, Roger Limouse...). Plusieurs générations d'artistes sont ainsi représentées autour de Raoul Dufy, des Nabis (Paul Sérusier, Edouard Vuillard, Pierre Bonnard...) et des post-cubistes (Marcel Gromaire, André Beaudin, Francisco Borès...).