La Transjeune réunit chaque année 3000 skieurs venus de toute la Franche-Comté mais aussi des départements limitrophes et de la Suisse Voisine. Agés de 7 à 19 ans, ces graines de champions se retrouvent aux Rousses pour une journée de ski de fond avec leurs camarades de classe, d'école, de clubs ou leurs amis et familles. En effet, la Transjeune est organisée en partenariat avec le sport scolaire (UNSS et USEP)Elle est également une épreuve comptant pour les sélections aux Championnats de France scolaires.

La Transjeune regroupe 26 courses tout au long de la journée : les distances à parcourir, les heures et lieux de départ sont déterminés par l'année de naissance.